人/小鼠/大鼠核糖体去除试剂盒,兼容常规样本以及各种质量的FFPE样本。
Hieff NGS ® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)利用RNase H消化法去除人、小鼠和大鼠来源总RNA 中的核糖体 RNA 和 45S ITS/ETS 区域以保留信使 RNA (mRNA)和其它非编码 RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总 RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA 去除效果。由于降解的FFPE样本相比新鲜组织样本通常含有较高比例的ITS/ETS, 该试剂盒人、小鼠和大鼠 45S ITS/ETS 区域的探针,经该试剂盒去除后可显著提高测序结果中有效数据比例。
- 覆盖人/小鼠/大鼠核糖体去除,rRNA残留率低。
- RNaseH酶法去除,去除效率高。
- 包含人ITS/ETS序列,兼容各种不同的FFPE样本。
- 兼容性好:适配下游各种不同品牌RNA建库试剂盒。
1、不同质量FFPE样本,rRNA残留率更低。
不同Human RNA样本分别使用不含ITS/ETS去除和含ITS/ETS去除的rRNA去除试剂盒进行文库构建,经测序分析rRNA与ITS/ETS在下机数据中的占比,含ETS/ITS探针的试剂,结果有效数据更高。
2、竞品对比结果更佳
对比N*以及本产品,进行文库上机测序,对数据进行分析比较,本产品测序后有效数据量更高。
-25~-15℃保存。
Q:12257去除rRNA有残留?
A:(1)RNase H Buf&RNase H混Mix放置稳定性较差,建议RNase H消化步骤单加或配Mix现配现用(配置好后10min内用完);(2)混匀不彻底导致rRNA残留,建议使用振荡器“隔手轻振”的方式混匀样品。
Q:RNaseH单酶稳定性如何?4℃放置会影响rRNA去除效果吗?
A:RNaseH单酶稳定性良好,翌圣测试4℃放置11天rRNA去除效果仍然正常。
[1]Liu Y, Han R, Zhou L, et al. Comparative performance of the GenoLab M and NovaSeq 6000 sequencing platforms for transcriptome and LncRNA analysis [published correction appears in BMC Genomics. 2022 Jan 26;23(1):81]. BMC Genomics. 2021;22(1):829. Published 2021 Nov 17. doi:10.1186/s12864-021-08150-8(IF:4.547)
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