Hifair®III 1st Strand cDNA Synthesis Kit (gDNA digester plus)是含有gDNA去除步骤的cDNA第一链合成试剂盒。该试剂盒基于Hifair®III Reverse Transcriptase而开发。该酶cDNA合成速度快,且热稳定性大幅度提高,可耐受高达60℃的反应温度,适合具有复杂二级结构的RNA模板的逆转录。同时,该酶增强了与模板的亲和力,适合少量模板以及低拷贝基因的逆转录。Hifair®III Reverse Transcriptase合成全长cDNA的能力也有了提升,可合成长达19.8 kb的cDNA。
该试剂盒包含gDNA digester Mix,可去除RNA模板中残留的基因组DNA污染,保证后续结果更加可靠。该试剂盒提供两种cDNA合成引物:Random Primers N6和Oligo (dT)18,用户可根据需要,选择Random Primers N6,Oligo (dT)18或Gene Specific Primers作为逆转录引物,合成的单链cDNA产物可直接用来进行后续PCR或者qPCR反应。
产品组分
组分编号 | 组分名称 | 11139ES10 | 11139ES60 |
---|---|---|---|
11139-A | RNase-free H2O | 1 mL | 2×1 mL |
11139-B | 5×gDNA Digester Mix | 30 μL | 300 μL |
11139-C | 10×Hifair® III Super Buffer | 20 μL | 200 μL |
11139-D | Hifair® III RT Enzyme Mix | 10 μL | 100 μL |
11139-E | Random Primers N6 (50 μM) | 10 μL | 100 μL |
11139-F | Oligo (dT)18 (50 μM) | 10 μL | 100 μL |
- 耐热性好:耐受60℃,适合具有复杂二级结构的RNA模板
- 引物灵活:可根据个人需求,搭配引物
- 兼容性高:适合不同GC含量、不同表达丰度基因反转录
- 合成能力强:最长可合成19.8kb的cDNA
-25~-15℃避光储存,有效期18个月。
Q:逆转录反应中的引物如何选择?
A:根据实验目的不同,可按下列建议选择(选择指南可见下表): a)对于全长第一链 cDNA 合成,且模板为真核生物来源,推荐选择Oligo (dT)引物。b)当目标区域具有复杂二级结构或模板为原核生物来源,推荐选择 Random Primers 引物。 c)基因特异性引物(GSP)是与模板序列互补的引物,适用于目的序列已知的情况。d)若逆转录后续为 qPCR 实验,可将 Oligo (dT)与Random Primers 混合使用。 逆转录引物选择指南 特征 优点 缺点 结合方式 Oligo (dT) 1)12-20 个 T; 2)与真核生物 mRNA 的3 ’ Poly A 尾配对。 可 合 成 全长 cDNA。 1 ) 仅扩增有 polyA 尾 的 mRNA; 2 ) 对模板质 量 要 求高。 Random Primers 1)6-9 个碱基; 2)可随机识别模板并结合。 适 合 复 杂结 构 和 微 量模板。 特异性低, 小片段多。 基因特异性 引 物 (GSP) 识别特定模板序列。 特异性强, 灵敏度高。 仅 合 成 特定的序列。
Q:能否用来做 miRNA/circRNA/lncRNA 的逆转录?
A:有 A 尾的 lncRNA 用预混液和 KIT ( 11123/11141/11121/11139) 都可以, circRNA、miRNA 和无 A 尾的 lncRNA 用 KIT(11121/11139)。microRNA 需要特殊的茎环引物,需特别针对的逆转录试剂盒。 Q:克隆逆转和定量逆转有什么区别?克隆逆转产物和定量逆转产物可以相互吗? A:a)目的不同:克隆逆转后的 cDNA 后续用于基因克隆,后续实验以普通 PCR 为主; 定量逆转后的 cDNA 后续用于基因定量,后续实验以qPCR 为主。 逆转录过程不同:克隆逆转使用 Oligo dT,保证合成的长度。随机引物使用较少; 定量逆转使用 Oligo dT 或随机引物,或两者混合使用。 克隆逆转产物可用于 qPCR,但定量逆转产物不推荐用于普通 PCR,定量逆转试剂中含 Oligo (dT)与 Random Primers 混合引物,产物长度较短,可做短片段 PCR,过长的不适合。
Q:逆转录试剂盒可以逆转真菌(或其他物种)RNA 吗?有没有专门针对真菌(或其他物种)的RNA 逆转录的试剂盒呢?
A:RNA 的物种与逆转录没有很大关系,RNA 质量与逆转录有关。所以,得到 RNA 后, 逆转录试剂盒都可以用,没有特别针对的。
Q:RNase 残留降解RNA?
A:原因:若去除试剂中残留 RNase,会使 RNA 发生降解,减少了 RNA 模板量,导致效果差。检测方法:RNA 去除试剂前后分别进行电泳检测,检测RNA 完整性。优化方法:选用无RNase 级别的 gDNA 去除试剂。
Q: miRNA茎环法逆转录可以用这款产品吗?
A: 可以的,设计特异性引物替代试剂盒中的引物加入到程序中。参考程序如下:
茎环引物(10uM) :1ul
上一步的反应液:15ul
10×super buffer:2ul
RT enzyme mix: 1ul
ddH2O: 1ul
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