ArCas12a核酸内切酶,源自Agathobacter rectalis细菌的CRISPR系统,别名Cpf1,是一个包含1263个氨基酸的单体蛋白。作为CRISPR/Cas系统的II类(V型)成员,ArCas12a仅由单一的效应蛋白行使功能,其特性与Cas9存在显著差异,例如靶向富含T的基序、不需要反式激活crRNA、DNA双链断裂产生粘性末端、参与RNA加工、具有DNA核酸酶活性等。
Cas12a缺乏HNH结构域,可单独利用其RuvC结构域在CRISPR RNA(crRNA)引导下识别位于靶标核酸5’端富含胸腺嘧啶(T)的PAM区而启动对靶标DNA的切割,已成功用于许多哺乳动物和植物的基因组编辑。此外Cas12a还具有反式切割活性,可不加选择地切割反应体系中的非靶标单链DNA。
与其它LbCas12a/AsCas12a相比,ArCas12a具有更高的温度适应性(25-55℃),可适用于基因组编辑及核酸检测等。
- 双链DNA高效体外切割;
- 反式切割活性强,可用于核酸检测;
- 与其它LbCas12a/AsCas12a相比,ArCas12a具有更高的温度适应性(25-55℃),可适用于基因组编辑及核酸检测等。
- 双链DNA高效体外切割
以双链DNA模板为靶标,加入ArCas12a、crRNA(存在与模板DNA序列互补的spacer区)进行体外切割,琼脂糖凝胶电泳检测切割效果。结果显示翌圣的ArCas12a在crRNA的引导下可高效的切割双链DNA(600 bp)产生两段切割产物(200 bp/400 bp)。
图1. ArCas12a顺式切割活性检测 M:Marker;C:模板双链DNA.
2、反式切割活性强,可用于核酸检测
以双链DNA模板为靶标,加入ArCas12a、crRNA(存在与模板DNA序列互补的spacer区)及单链DNA报告探针(含有荧光报告集团)进行体外切割,当ArCas12a与crRNA及靶标DNA形成复合体后会激活反式切割活性,切割单链DNA报告探针,从而发出荧光。结果显示,翌圣ArCas12a与crRNA及模板DNA形成复合体后具有反式切割活性,可剪切单链DNA。
图2. ArCas12a反式切割活性检测
3、无核酸外切酶残留
将底物DNA与10 pmol ArCas12a共同孵育,琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示翌圣的ArCas12a无核酸外切酶残留。
图3. ArCas12a核酸外切酶残留检测 C:阴性对照
4、无RNase残留
将底物RNA与5 pmol ArCas12a共同孵育,琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示翌圣的ArCas12a无RNase残留。
图4. ArCas12a RNase残留检测 C:阴性对照
-25~-15℃保存,有效期2年。
Q:14702ES 浓度是多少?100pmol 这个体积是多少?
A:10pmol/μL。100pmol就是10μL。